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                類器官RNA和蛋白提取方法

                更新時間:2023-10-19      點擊次數:850

                很多老師咨詢類器官RNA和蛋白如何提取,其實類器官可以按微小組織進行RNA和蛋白提取,今天小愛給大家講一講提取方法。

                 

                類器官蛋白提取方法

                 

                一、試劑準備(細胞漿、細胞核及細胞膜蛋白抽提試劑盒(abs9346))

                 

                1、準備溶液

                1)室溫融解試劑盒中的各種溶液,溶解后除結構蛋白提取液外,其他試劑立即置于冰上;

                2)結構蛋白提取液溶解后,可放置于37℃水浴中溫浴至透明后,常溫放置。

                 

                2、蛋白提取工作液的準備

                1)胞漿蛋白提取工作液的準備:臨用前,根據處理樣品的量估算實驗時胞漿蛋白提取液的需要量,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF;

                2)胞核蛋白提取工作液的準備:臨用前,根據處理樣品的量估算實驗時胞核蛋白提取液的需要量,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF;

                3)膜蛋白提取工作液的準備:臨用前,根據處理樣品的量估算實驗時膜蛋白提取液的需要量,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF;

                4)結構蛋白提取工作液的制備:臨用前,根據處理樣品的量估算實驗時結構蛋白提取液的需要量,并分別按照1:50比例加入磷酸酶抑制劑II和1:100比例加入蛋白酶抑制劑PMSF。

                 

                二、類器官收集及洗滌

                 

                1、類器官收集

                移液器吸去培養基,每孔添加1-2mL左右4℃類器官傳代培養緩沖液(abs9730),輕柔吹打基質膠,收集在15mL離心管中(24孔板,每5孔為一組),4℃靜置10min或-20℃放置5min(目的是使基質膠軟化),300g ,4℃, 離心5min棄上清。

                 

                2、類器官清洗

                添加1mL類器官傳代培養緩沖液重懸,300g ,4℃,離心5min棄上清。

                 

                三、類器官蛋白提取

                 

                1、胞漿蛋白提取

                1)向含類器官沉淀的EP中加入2mL的胞漿蛋白提取工作液,在4℃條件下震蕩20min;

                2)準備1-5mL的注射器,用注射器吹打步驟1震蕩過的溶液50-90次,在4℃條件下,15000g離心10min。取上清液存于EP管中,即為胞漿蛋白。

                 

                2、胞核蛋白的提取

                取3.1.2步驟獲得的沉淀物加入4mL冰浴的胞漿蛋白提取工作液,在4℃條件下震蕩5min,4℃條件下15000g離心10min,棄去上清液,沉淀物中加入1mL冰凍的胞核蛋白提取工作液,在4℃條件下震蕩5min,4℃條件下15000g離心10min,上清液為細胞核蛋白,轉入EP管并保存。

                 

                3、胞膜蛋白的提取

                在步驟3.2中的沉淀物中加入1mL冰凍的膜蛋白提取工作液,在4℃條件下震蕩5min,4℃條件下15000g離心10min,上清液為細胞膜蛋白,轉入EP管并保存。

                 

                4、結構蛋白的提取

                在步驟3.3的沉淀物中加入常溫或37℃水浴過的透明的結構蛋白提取工作液0.5mL,4℃條件下震蕩5min,4℃條件下15000g離心10min,保存上清液即為細胞骨架蛋白。

                 

                5、待測蛋白的保存待檢測濃度的蛋白存于-70℃,可以用于Western,EMSA,footprinting,報告基因檢測以及酶活力測定等后續操作。

                 

                類器官RNA提取方法

                 

                一、類器官收集及洗滌

                 

                1、類器官收集

                移液器吸去培養基,每孔添加1-2mL左右4℃類器官傳代培養緩沖液(abs9730),輕柔吹打基質膠,收集在15mL離心管中(24孔板,每5孔為一組),4℃靜置10min或-20℃放置5min(目的是使基質膠軟化),300g ,4℃, 離心5min棄上清。

                 

                2、類器官清洗

                添加1mL類器官傳代培養緩沖液重懸,轉移到1.5mL EP管,300g ,4℃,離心5min棄上清。

                 

                二、類器官RNA提取(超純總RNA快速提取試劑盒(含DNase I),貨號abs60026)

                 

                1、向含類器官沉淀的EP中加入1mL的RL(試劑盒組分)溶解細胞,并用移液槍輕輕吹打混勻,使RL充分和類器官接觸裂解細胞并滅活RNA酶;
                2、將勻漿樣品劇烈震蕩混勻,在15-30°C條件下孵育5min以使核蛋白體分解;
                3、每1mL RL加0.2mL氯仿。蓋緊樣品管蓋,劇烈振蕩15sec并將其在室溫下孵育3min;
                4、于4℃,12000 rpm離心10min,樣品會分成三層:下層有機相,中間層和上層無色的水相,RNA存在于水相中。水相層的容量大約為所加RL體積的60%,把水相轉移到新管中,進行下一步操作;
                5、加入1倍體積70%乙醇(請先檢查是否已加入無水乙醇!),顛倒混勻(此時可能會出現沉淀)。得到的溶液和可能沉淀一起轉入吸附柱RA中(吸附柱套在收集管內);
                6、12000 rpm 離心45sec,棄廢液,將吸附柱重新套回收集管;
                7、加400μL去蛋白液RE,12000 rpm 離心45sec,棄廢液;
                8、DNase I工作液的配制:取10μL DNase I儲存液放入新的RNase-free離心管中,加入70μL RDD溶液,輕柔混勻;
                9、向吸附柱RA中央加入80μL DNase I工作液,室溫放置15min(一般情況下室溫放置可得到較好的消化效果,如果室溫效果不佳可選擇在37℃放置15min);
                10、加400μL去蛋白液RE,12000 rpm 離心45sec,棄掉廢液;
                11、加入500μL漂洗液RW(請先檢查是否已加入無水乙醇!),12000 rpm離心45sec, 棄掉廢液;
                12、加入500μL漂洗液RW,12000 rpm 離心45sec,棄掉廢液;
                13、將吸附柱RA放回空收集管中,12000 rpm離心2min,盡量除去漂洗液,以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應;
                14、取出吸附柱RA,放入一個RNase free離心管中,根據預期RNA產量往吸附膜的中間部位加50-80μL RNase free H2O(事先在 65℃水浴中加熱效果更好),室溫放置2min,12000 rpm 離心1min,所得溶液即為RNA溶液。如果需要較多RNA,可將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,離心1min。

                 

                提取得到的RNA溶液,可以直接應用于Northern 雜交、RT-PCR、Real Time RT-PCR、cDNA文庫構建、體外翻譯等各種常規分子生物學實驗。

                 

                今天講解就到這了,大家如有實驗問題,歡迎公眾號“愛必信生物"后臺交流哦!

                 

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                規格

                abs9346

                細胞漿、細胞核及細胞膜蛋白抽提試劑盒

                50T

                abs60026

                超純總RNA快速提取試劑盒(含DNase I)

                20T/50T

                abs9730

                類器官傳代培養緩沖液

                250ml/ 250ml

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                基質膠(低因子、無酚紅)

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