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                關(guān)于WB實驗中的marker,你應(yīng)該知道的事

                更新時間:2024-10-23      點擊次數(shù):2189

                1、什么是蛋白marker?

                 

                蛋白Marker,也稱為蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)(Protein Molecular Weight Marker),是用于蛋白質(zhì)電泳分析中的一系列已知分子量的蛋白質(zhì)混合物。它們通常包含多個不同分子量的蛋白質(zhì)條帶,這些條帶在電泳過程中會根據(jù)分子量的大小和電荷差異遷移不同的距離,從而在凝膠上形成一系列有序的條帶。

                 

                2、Marker在WB中的作用?

                 

                分子量標(biāo)定:Marker包含一系列已知分子量的蛋白質(zhì),通過與Marker上的帶狀蛋白質(zhì)帶進行比較,可以精確地確定待測蛋白的分子量;

                驗證電泳和轉(zhuǎn)印效果:Marker在電泳和轉(zhuǎn)印的過程中移動到膜上,可以幫助研究者驗證這些步驟的效果。通過檢查Marker的帶狀分布,可以確保電泳和轉(zhuǎn)印過程中沒有發(fā)生異常;

                確定蛋白質(zhì)遷移距離:通過測量Marker的遷移距離,可以估算待測蛋白質(zhì)的遷移距離。這對于進一步的數(shù)據(jù)分析和結(jié)果解釋非常重要;

                標(biāo)定凝膠濃度:Marker還可以用于幫助研究者選擇適當(dāng)?shù)哪z濃度。不同分子量的Marker在不同的凝膠濃度下會產(chǎn)生不同的遷移模式,因此可以根據(jù)Marker的遷移特性選擇合適的凝膠濃度。

                 

                3、Marker有哪些分類,各有什么特點?

                 

                ● 天然蛋白Marker:

                 

                這類Marker是從自然來源提取的蛋白質(zhì),它們經(jīng)歷了天然的修飾過程,如裂解、二硫鍵形成、糖基化或磷酸化,并保持其復(fù)雜的3D結(jié)構(gòu)。天然蛋白Marker更接近其在體內(nèi)的自然狀態(tài),這使得它們在藥物開發(fā)和生物醫(yī)學(xué)研究中非常有用。天然蛋白Marker可以提供更準(zhǔn)確的分子量估計,因為它們未經(jīng)過重組或合成,保持了蛋白質(zhì)的自然特性。abs9919非變性蛋白Marker (66-669kDa),經(jīng)過非變性電泳后,用考馬斯亮藍染色后可以得到分布均勻、密度相近的4條帶,不適用于SDS-Page,因為在SDS存在下,含有多個亞單位的蛋白會不同程度解聚。

                 

                abs9919非變性蛋白Marker(66-669kDa)

                 

                ● 變性Marker:

                 

                這類Marker在生產(chǎn)過程中經(jīng)過了變性處理,通常是通過加熱和化學(xué)物質(zhì)(如SDS)的處理,以確保蛋白質(zhì)wan全展開成線性結(jié)構(gòu)。變性Marker的優(yōu)點在于它們提供了一致的蛋白質(zhì)遷移特性,這對于精確的分子量估計和實驗重復(fù)性非常重要。由于變性處理,這類Marker的蛋白質(zhì)保持一致的電荷和形狀,使得它們在電泳過程中的遷移更加可預(yù)測。

                 

                變性蛋白Marker一般可分為預(yù)染和非預(yù)染兩種

                 

                ● 未預(yù)染蛋白Marker:

                 

                這類Marker包括寬分子量、高分子量和低分子量蛋白標(biāo)準(zhǔn)。它們是較簡單、較準(zhǔn)確的一種,因為不附帶染料分子或標(biāo)記分子,所以所示大小正好是蛋白原本的大小。缺點是在電泳過程中不可見,需要在電泳結(jié)束后經(jīng)過染色才能看到,無法實時監(jiān)控電泳過程。適合精確判斷蛋白大小,但操作相對麻煩,需要額外的染色步驟。如abs9840非預(yù)染蛋白Marker (14.4-97.4kDa),用考馬斯亮藍R-250染色可得分布均勻密度相同的六個條帶,產(chǎn)品含SDS, 不適合用于非變性膠。

                 

                abs9840非預(yù)染蛋白Marker(14.4-97.4kDa)

                 

                ● 預(yù)染蛋白Marker:

                 

                這類Marker在生產(chǎn)時就結(jié)合了染料,因此在電泳過程中或轉(zhuǎn)膜時可以直接觀察到不同顏色的條帶。預(yù)染蛋白Marker方便實驗人員在電泳時、電泳后,以及轉(zhuǎn)膜后監(jiān)測電泳情況和估計遷移率。又分為單色預(yù)染和多色預(yù)染。單色預(yù)染Marker通常會利用其中某些條帶加倍濃度來提示其大小,而多色預(yù)染Marker用不同的顏色來區(qū)別,更易于辨認 。需要注意的是,預(yù)染蛋白Marker與染料共價耦聯(lián),所以在不同的緩沖條件下電泳時遷移特性可能會發(fā)生某些變化,可能導(dǎo)致一些偏差,因此不太適合精確定位蛋白。

                 

                abs923預(yù)染蛋白Marker(10-245kDa)

                 

                ● 預(yù)染發(fā)光Western Marker

                 

                傳統(tǒng)的Western Blot試驗需要使用預(yù)染蛋白Marker來跟蹤檢測陽性抗原信號和轉(zhuǎn)膜效率,但預(yù)染蛋白Marker無法在膠片上曝光,曝光信號需要根據(jù)膜上的預(yù)染蛋白Marker來判斷。absin新品abs90004 預(yù)染發(fā)光Western Marker由9種發(fā)光蛋白和9種預(yù)染蛋白組成;9中發(fā)光蛋白分別為23、30、36、44、50、62、90、120和160KDa,這些蛋白均可與抗體結(jié)合,因此能與抗原在同一張膜上曝出信號,陽性信號可以直接通過Western Marker的位置來判斷;9種預(yù)染蛋白分別為15、25、35、40、55、70、100、130和180KDa,其中70KDa為紅色,其他為藍色,轉(zhuǎn)膜完畢后在膜上肉眼可見。

                1)可與抗原同時檢測信號,使Western blot結(jié)果判斷更加簡便;

                2)發(fā)光marker沒有偶聯(lián)和標(biāo)記其他分子,分子量更加準(zhǔn)確;

                3)綜合發(fā)光marker和預(yù)染marker的優(yōu)勢,既能監(jiān)測轉(zhuǎn)膜又能與抗原同時檢測。

                 

                HRP標(biāo)記的Goat anti mouse IgG二抗(一抗:mouse anti P38)ECL化學(xué)發(fā)光檢測

                 

                多重?zé)晒鈾z測

                 

                按照分子量又可以將marker分為高分子量、低分子量、寬分子量等。高分子量蛋白Marker是指那些用于檢測大分子量蛋白質(zhì)的標(biāo)記,通常包含的蛋白質(zhì)分子量范圍較高,它們提供的分子量范圍通常從幾十kDa到幾百kDa不等。低分子量蛋白Marker是指用于檢測小分子量蛋白質(zhì)的標(biāo)記,通常包含的蛋白質(zhì)分子量范圍較低,從幾kDa到幾十kDa的分子量范圍。寬分子量蛋白Marker是指覆蓋寬廣分子量范圍的標(biāo)記,通常包含從低到高多個分子量的蛋白質(zhì)。

                 

                4、如何選擇marker?需要考慮什么因素?

                 

                首先看實驗類型,非變性蛋白需要非變性蛋白marker,變性蛋白則需要變性marker,兩者不可以相互替換,然后看目的蛋白大小,選擇相應(yīng)的marker,在可選條件下,寬分子量蛋白marker,是不錯的選擇,另外看實驗要求,如果需要在電泳和轉(zhuǎn)印過程中檢測,需要選擇預(yù)染marker,如果需要精確的條帶分子量大小,則需要非預(yù)染marker做參考,可以同時使用預(yù)染marker和非預(yù)染marker,除了以上因素,還需要考慮marker的使用體系,absin常見marker信息如下:

                 


                類型

                非變性蛋白marker

                非預(yù)染蛋白 Marker

                藍色預(yù)染蛋白 Marker

                多色預(yù)染蛋白Marker

                預(yù)染發(fā)光Western Marker

                貨號

                abs9919

                abs9840

                abs9511

                abs9859

                abs922

                abs923

                abs924

                abs90004

                分離量范圍

                66-669kDa

                14.4-97.4kDa

                3.3-31kDa

                14.4-97.4kDa

                10-180kDa

                10-245kDa(Tris-glycine-SDS)

                10-180kDa

                發(fā)光蛋白:23-160kDa

                預(yù)染蛋白:15-180kDa

                條帶數(shù)量

                4

                6

                5

                6

                10(10和17可能因為膠濃度原因跑不開)

                12

                10(10和17可能因為膠濃度原因跑不開)

                9

                條帶分子量

                66、238、440、669

                14.4、22、31、43、66.2、97.4

                3.3、6.5、14.4、20.1、31

                14.4、20.1、31、43、66.2、97.4

                10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180

                11、17、20、25、35、48、63、75、100、135、180、135、180、245(Tris-glycine-SDS)

                10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180

                發(fā)光蛋白: 23、30、36、44、50、62、90、120 、 160

                預(yù)染蛋白: 15、25、35、40、55、70、100、130 、 180

                顏色

                單色

                單色

                藍色

                藍色

                75紅色,25k綠色,其余藍色

                25綠色,75橙紅色,其余藍色

                72橙色,10綠色,其余藍色,10k條帶在15%以下膠濃度時深綠色

                預(yù)染蛋白70KDa為紅色,其他為藍色,

                推薦凝膠體系

                非變性電泳

                變性電泳

                Tricine SDS-PAGE

                Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進口一致

                Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進口一致

                Tris-Glycine
                Bis-Tris MOPS
                Bis-Tris MES

                Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進口一致

                Tris-Glycine,Bis-Tris等

                處理

                需要考馬斯亮藍染色,不能加熱

                需要考馬斯亮藍染色及上樣前沸水浴

                無需染色,勿加熱

                無需染色、無需加熱

                無需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理

                無需染色、無需加熱

                無需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理

                無需染色、直接使用,不要煮沸




                 

                非變性蛋白電泳好物推薦


                貨號

                產(chǎn)品名稱

                規(guī)格

                abs9116

                免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液

                100mL

                abs9360

                Tris-Glycine電泳緩沖液(10×)

                500mL

                abs9618

                Glass gel預(yù)制膠 Tris-Gly 15%, 10wells, 1.5mm

                10片/盒

                abs9954

                非變性非還原性蛋白上樣緩沖液(5×)

                1mL×5

                abs9919

                非變性蛋白 Marker(66-669kDa)

                200uL

                abs964

                考馬斯亮藍染色試劑盒(常規(guī)型)

                1kit




                 

                WB好物推薦


                 

                貨號

                產(chǎn)品名稱

                規(guī)格

                樣本處理

                abs9346

                細胞漿、細胞核及細胞膜蛋白抽提試劑盒

                50T

                abs9116

                免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液

                100mL

                abs9162

                廣譜型磷酸酶抑制劑混合物(100×儲液)

                1mL

                abs9161

                廣譜型蛋白酶抑制劑混合物(不含EDTA,100×DMSO儲液)

                1mL

                蛋白定量

                abs9232

                BCA蛋白定量試劑盒

                500T

                配膠試劑盒,各類預(yù)制膠(參考前面表格)

                上樣與電泳

                abs953

                上樣緩沖液(2×)

                10mL

                abs951

                電泳液(10×)

                100mL

                abs923

                預(yù)染蛋白Marker(10-245kDa)

                500uL

                轉(zhuǎn)膜

                abs932

                PVDF膜(0.45μm)

                20張

                abs960

                NC膜(0.45μm)

                20張

                abs950

                電轉(zhuǎn)液(10×)

                100mL

                封閉

                abs9175

                脫脂奶粉

                500g

                abs9157

                牛血清白蛋白

                100g

                抗體稀釋與去除

                abs954

                WB專用一抗二抗稀釋液

                100mL

                abs967

                Western一抗二抗去除液(強堿性)

                500mL

                顯色與檢測

                abs920

                ECL化學(xué)發(fā)光檢測試劑盒

                25mL×2




                 

                 

                Absin產(chǎn)品線:

                爆款產(chǎn)品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測、殘留檢測、多因子檢測);細胞培養(yǎng)(類器官試劑盒+基質(zhì)膠,胎牛血清+培養(yǎng)添加劑+細胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務(wù)+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測)...

                特色產(chǎn)品:雞胚提取物CEE、B27、N2、霍亂毒素B亞單位CTB、牛腦垂體提取物BPE、百日咳毒素PTX、重組人胰島素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...

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